根管治療の目的は根尖性歯周炎の予防と治療です。
根管全て、アクセサリー根管も全ての細菌を減らす事が重要です。
アクセサリー根管に充填する事が、その歯科医の技術と成功を表していると思われているむきもあります。
しかしその様な歯を抜いて組織標本にして顕微鏡下で調べてみると、
レントゲンでは入っているようにに見えたアクセサリー根管は、しっかりと詰められてはいませんでした。
レントゲンでは上手に詰められているように見えたのに、
実際には残った神経(生きているのや死んだものも)にシーラーってセメントが絡みついているだけでした。
確かに入る込んだシーラーの抗菌作用によって残った細菌を弱めたり、生き埋めに閉じ込めるって効果もあるかもしれませんが。
メインの根管，本管の細菌を徹底的に消毒して、しっかりと封鎖できれば、
アクセサリー根管を通しての感染を防げると思われます。

アクセサリー根管を機械的に削り取ることは出来ません。
更にメインの根管を削っていると、わきのアクセサリー根管へ削りカスを押し込んでしまうってことも分かっています。
洗浄法や技術進歩によってアクセサリー根管の消毒出来るようになるでしょう。
しかし、今現在ではそこを完全にキレイにして、乾燥させて、詰めることは出来ません。
最善を尽くしても、根管全てを完全に消毒して、乾燥、充填する事は出来ないのです。